Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp3a41aQ9JMA7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms