Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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