Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms