Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SacsQ9JLC8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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