Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrac1Q9JKP8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrac1Q9JKP8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms