Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole3Q9JKP7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pole3Q9JKP7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms