Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrQ9JKK8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms