Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trem1Q9JKE2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms