Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uchl3Q9JKB1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms