Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms