Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga3Q9JJZ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms