Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alyref2Q9JJW6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms