Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ascl3Q9JJR7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms