Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN0

Polh, DNA polymerase eta, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolhQ9JJN0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PolhQ9JJN0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolhQ9JJN0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms