Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Efcc1Q9JJF6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms