Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rpf2Q9JJ80 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms