Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip1Q9JJ57 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms