Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad9Q9JIW5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms