Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmbr1Q9JIT0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmbr1Q9JIT0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms