Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smco4Q9JIS3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms