Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r3fQ9JIG4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms