Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cxcl11Q9JHH5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcl11Q9JHH5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
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