Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc5a4aQ9ET37 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a4aQ9ET37 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms