Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms