Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtn3Q9ES97 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rtn3Q9ES97 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Rtn3Q9ES97 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtn3Q9ES97 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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