Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube3bQ9ES34 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms