Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
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