Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms