Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms