Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rapgef4Q9EQZ6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Rapgef4Q9EQZ6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rapgef4Q9EQZ6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
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