Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr9Q9EQU3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms