Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
V1ra8Q9EQ48 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms