Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold3Q9EQ28 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold3Q9EQ28 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold3Q9EQ28 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold3Q9EQ28 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold3Q9EQ28 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold3Q9EQ28 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pold3Q9EQ28 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pold3Q9EQ28 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold3Q9EQ28 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pold3Q9EQ28 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms