Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms