Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cpsf1Q9EPU4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cpsf1Q9EPU4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms