Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn1Q9EPL2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms