Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rp2Q9EPK2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp2Q9EPK2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rp2Q9EPK2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rp2Q9EPK2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rp2Q9EPK2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rp2Q9EPK2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp2Q9EPK2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms