Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms