Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms