Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Xrn2Q9DBR1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms