Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ftsj3Q9DBE9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms