Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March8Q9DBD2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms