Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc54Q9DAL3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms