Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Sgf29Q9DA08 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms