Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9S1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9S1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q9D9S1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9S1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9S1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9S1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D9S1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms