Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt2Q9D9L5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms