Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Actrt1Q9D9J3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.4 ms