Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cntd1Q9D995 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntd1Q9D995 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms