Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc2Q9D968 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms