Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms